С 1992 года Михаил Дворников начал заниматься бизнесом, имел ряд предприятий в сфере торговли, а также оказания консалтинговых услуг, в том числе консультаций по приватизации. С 1994 года сфера бизнеса расширилась и Михаил Дворников начал принимать участие в покупке (на вторичном рынке) приватизированных предприятий в стадии банкротства. Так им были приобретены ряд крупных предприятий в Москве для последующего перепрофилирования и использования как объектов недвижимости. В числе основных предприятий значатся торговые комплексы «Савеловский» и «Станколит», а также ряд более мелких предприятий.

Михаил Дворников являлся владельцем ряда компаний, имеющих в активах крупные объекты недвижимости в Москве (РФ). По состоянию на 2006 год стоимость активов Михаила Дворникова в недвижимости оценивалась 200 млн. долларов США, а годовая валовая прибыль составляла 60 млн. долларов США.

В период с 2006 по 2008 год все активы и бизнес в Москве (РФ) были проданы. В настоящее время Михаил Дворников является частным инвестором и владельцем ряда компаний в Австрии и Швейцарии, ведет благотворительную, общественную и научную деятельность.